中國保健食品企業多為中小企業，生產規模小，品牌產品少，產業集中度低。據統計，目前中國保健食品生產企業有2,000余家，年產值已達2,600億元，其中年產值上億元的企業僅70多家，約占總產值38%。行業“多、小、散、亂、低”特征明顯；企業研發投入不足，創新能力較弱，技術水平不高，缺乏核心競爭力。
　　從質量安全狀況來看，假冒偽劣現象嚴重，原料質量控制措施缺失，產品質量安全控制水平不高，部分企業的產品備案標準擅自更改批準內容，非法添加情況時有發生，尤其是減肥、輔助降血糖等功能的保健食品，對消費者的身體健康構成了潛在威脅。
　　從生產經營秩序來看，一些企業主體責任意識淡薄，質量管理體系不完善，從業人員素質較低，規范化、標準化程度有待進一步提高。生產企業原料把關不嚴、生產規范執行不力、委托加工管理不規范、經營企業索證索票和進貨查驗制度執行不到位等問題突出。個別企業自律意識不強，誠信意識較差，不按批準配方工藝組織生產。一些企業虛假夸大宣傳，甚至利用不法手段坑害消費者，缺乏基本職業道德和操守。
　　總體來看，目前中國保健食品行業仍存在著產業集中度低、非法添加違禁藥物、違法違規生產經營、虛假夸大宣傳、市場產品魚目混珠等一系列問題。這些問題不解決好，將一直掣肘著保健食品行業的健康發展，打擊人們對保健食品的消費信心。

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